南普陀寺有众多值得游玩的地方，可从殿堂建筑、自然景观、文化场所及美食休闲这几类来介绍：
殿堂建筑
- 天王殿：南普陀寺的山门，殿内供奉着弥勒菩萨、韦护菩萨和四大天王。天王殿的建筑风格极具闽南特色，屋顶的飞檐装饰精美，色彩艳丽，灵动纤细。景点南普陀寺天王殿
- 大雄宝殿：汉传佛教寺院正殿，建筑形式为重檐歇山顶、抬梁式木石结构，崇宏雄伟。殿中供奉着“三世佛”，中间是本师释迦牟尼佛，西边是阿弥陀佛，东边是药师琉璃光如来，庄严肃穆。
- 大悲殿：位于大雄宝殿后门处的石砌多角形高台上，为八角亭楼建筑，殿阁中供奉四尊观音像，正中一尊为双臂观音，其余三尊为四十八臂观音，掌中各雕一只手眼，手持多种神器，姿态不一。
- 藏经阁：是寺院的最高殿堂，珍藏着数以千计的佛教文化艺术品，有大量珍贵的佛经、佛像、古书画等，如明万历年间血书《妙法莲华经》等。
自然景观
- 五老峰：与南普陀寺相邻，五个山头峥嵘凌空、横插天际、气派非凡，山上遍长着相思树，在这里可以观赏到厦门大八景之一“五老凌霄”，攀岩直上还能将美丽的厦门大学校园风光和厦门港景色一览无遗。
- 放生池：位于寺院前，池中有乌龟等生物，周边还有鸽子，适合带小朋友游玩，池边环境清幽，在此可感受宁静祥和的氛围。
文化场所
- 闽南佛学院：创办于1925年，是国内最早的佛教学府，在海内外久负盛名，学院的建筑风格独特，充满了浓厚的文化氛围，可在此感受佛法的传承和弘扬。景点南普陀寺闽南佛学院
- 太虚图书馆：馆内收藏了大量的佛教书籍和文献，是佛教文化研究和学习的重要场所，对佛教文化感兴趣的游客可以在此查阅资料，深入了解佛教文化。
美食休闲
- 南普陀素菜馆：位于南普陀寺东侧的普照楼内，有“天下第一素宴”的美誉，提供各种精美的素食菜品，如“半月沉江”“竹影情长”等，还有厦门特色小吃沙茶面等。
- 南普陀素饼：南普陀寺的特色美食，口感酥香，甜而不腻，有椰子味、南瓜味和绿豆味等多种口味可供选择，是非常不错的伴手礼。