在不同的疫情阶段，南京被划定为风险的景区有所不同，以下是一些曾被划定为风险或受疫情影响关闭的景区：
2021 年疫情期间
钟山风景名胜区 ：2021 年 7 月 31 日起，钟山风景区的孙中山纪念馆、明孝陵博物馆、南京抗日航空烈士纪念馆、美龄宫、东吴大帝孙权纪念馆等文博场馆均暂停向市民、游客开放 。 景点 南京钟山风景名胜区
江北新区各景区 ：2021 年 7 月 26 日起，江北新区范围内的景区全部暂停营业，包括但不限于珍珠泉旅游度假区等。
2022 年疫情期间
六合区相关景区 ：2022 年 6 月 27 日，因六合区龙池街道沿河花园小区调整为中风险地区，南京金牛湖野生动物王国、南京金牛湖景区、南京平山森林公园景区、南京巴布洛生态谷景区等发布闭园通知 。
华昌龙之谷乐园 ：2022 年 10 月 17 日，浦口区华昌龙之谷乐园被划定为中风险区 。
2022 年特定疫情防控要求下临时闭园景区
鸡鸣寺 ：2022 年 10 月 17 日 19 时起暂停对外开放。
中山植物园 ：2022 年 10 月 18 日起，南园温室（热带植物宫）暂停开放。
南京欢乐谷 ：2022 年 10 月 17 日至 10 月 20 日临时闭园。
栖霞古寺 ：2022 年 10 月 18 日起开始暂停对外开放，暂停聚集性宗教活动。
天生桥风景区 ：2022 年 10 月 17 日起临时闭园。
南京中国科举博物馆 ：2022 年 10 月 18 日起临时闭馆。
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