EM 菌（Effective Microorganisms）是一种由多种有益微生物组成的复合微生物制剂，包括乳酸菌、酵母菌、光合细菌等。它在果树上具有多方面的积极作用，主要体现在以下几点：
改良土壤结构与肥力 ：EM 菌中的有益微生物能够分解土壤中的有机物，比如动植物残体、腐殖质等，将其转化为腐殖酸、氨基酸等小分子物质，增加土壤腐殖质含量，使土壤变得疏松多孔，改善土壤的通气性和透水性，为果树根系生长创造良好的土壤环境。同时，这些微生物还能固氮、解磷、解钾，提高土壤中氮、磷、钾等养分的有效性，增强土壤肥力，减少化肥的使用量。
增强果树的抗病能力 ：EM 菌施入土壤后，有益微生物会在果树根际周围形成优势菌群，与有害微生物竞争生存空间和养分，抑制有害病原菌的生长繁殖，降低果树根部病害的发生几率，如根腐病、枯萎病等。而且，EM 菌在代谢过程中会产生一些抗菌物质，如抗生素、细菌素等，这些物质能够直接抑制或杀灭病原菌，增强果树的抗病能力。
促进果树生长发育 ：EM 菌能够产生生长素、细胞分裂素等植物生长调节物质，促进果树根系的生长和发育，增加根系的数量和长度，提高根系对养分和水分的吸收能力。根系健壮的果树地上部分生长也更加旺盛，枝繁叶茂，新梢生长快，叶片浓绿、厚实，从而提高果树的光合作用效率，为果实的生长发育提供充足的光合产物。
提高果实品质 ：使用 EM 菌后，果树能够吸收到更全面、均衡的养分，果实发育良好，大小均匀，色泽鲜艳，糖度增加，酸度降低，口感更好，风味更浓郁。同时，EM 菌还可以降低果实中的农药残留和有害物质含量，提高果实的安全性和商品价值，使其更符合市场对高品质水果的需求。
增强果树的抗逆性 ：在干旱、洪涝、高温、低温等逆境条件下，使用 EM 菌的果树表现出更强的适应能力。有益微生物能够调节果树的生理代谢，增加细胞内的可溶性糖、脯氨酸等物质的含量，提高果树的渗透调节能力，增强果树的抗寒、抗旱能力；还可以诱导果树产生一些抗逆相关的蛋白和酶，提高果树对逆境的抵抗力。
改善果园生态环境 ：EM 菌有助于减少果园中化肥和农药的使用量，降低对土壤、水体和空气的污染，保护果园中的有益生物，如蚯蚓、蜜蜂等，维持果园生态系统的平衡和稳定，促进果园的可持续发展。