厦门植物园景点丰富多样，包含雨林世界、沙生植物区等多个特色园区，以下是一些主要景点：
植物专类园区
- 雨林世界：是厦门植物园最受欢迎的景点之一。这里雾气朦胧，每天定时喷雾，营造出宛如仙境的氛围，尤其是在阳光的照射下，能够看到美丽的丁达尔效应。园区内种植了大量的热带雨林植物，如望天树、桫椤等，还有小瀑布等景观，充满了热带风情。景点厦门植物园雨林世界
- 沙生植物区：拥有众多形态各异的仙人掌和多肉植物，是网红打卡拍照的热门地点。这里模仿沙漠生态环境，种植了各种巨型仙人掌以及各类多肉植物，如金琥、龙舌兰等，在蓝天白云的映衬下，仿佛置身于沙漠之中。
- 松杉园：种植了大量的松杉类植物，如被人们称为“活化石”的水杉、银杏，还有世界三大观赏树之一的南洋杉等，这些植物树形优美，具有很高的观赏价值和科研价值。
- 棕榈园：集中展示了多种棕榈科植物，如大王椰子、狐尾椰子、酒瓶椰子等。这些棕榈树高大挺拔，叶子呈羽状或掌状分裂，具有浓郁的热带和亚热带风光特色，是拍照留念的好地方。
- 百花厅：位于万石湖畔东南的幽谷下，共有五个展览室，展览着二百多种奇花异卉，如卡特利亚兰、文心兰、能吃小动物的猪笼草等。回廊、曲桥、水榭串联其间，环绕着椭圆形的荷花池，环境十分优美。
人文自然景观
- 南洋杉草坪：邻近西门，是一片开阔的大草坪，周围种植着高大的南洋杉。这里是不少摄影师私藏的小众拍摄地，草坪绿意盎然，南洋杉姿态优美，与远处的山峦和天空相互映衬，构成了一幅美丽的自然画卷，适合拍摄森系风格的照片。
- 天界晓钟：天界寺位于植物园内，寺内的“天界晓钟”是厦门旧二十四景之一。寺庙建筑古朴典雅，环境清幽，清晨或傍晚时分，钟声回荡在山谷之间，给人一种宁静祥和的感觉。
- 万石涵翠：万石湖是厦门植物园的核心景观之一，湖水清澈碧绿，周围群山环绕，绿树成荫。湖面上常有游船穿梭，湖边设有亭台楼阁，游客可以在此休息、观赏湖光山色，享受大自然的宁静与美好。
- 新碑林：位于植物园内的高点，这里汇集了众多的石刻作品，展示了厦门的历史文化和书法艺术。登上新碑林的最高点，可以俯瞰半个厦门岛的美景，包括城市风光、大海、山峦等，视野十分开阔。
其他特色景点
- 动物奇妙馆：馆内有鲻鱼头的羊驼、黑山羊、梅花鹿、兔子、蜥蜴等多种可爱的动物，游客可以购买门票进入，与动物亲密接触，还能获得喂养的饲料，深受小朋友们的喜爱。
- 南门网红观光扶梯：从南门进入植物园，可以乘坐网红观光扶梯，扶梯有6、7段，沿途可以欣赏到厦门的山海美景，仿佛进入时空隧道，到达山顶后还可以走在观景栈道上，拍摄远处的大海和城市风光，非常出片。