以下是一些比较著名的南山寺内景点：
三亚南山寺
- 大雄宝殿：南山寺正殿，供奉着三世佛，正中是婆娑世界的教主释迦牟尼佛，右侧是西方极乐世界的教主阿弥陀佛，左侧是东方琉璃世界的教主药师佛，左前方是迦叶尊者，右前方是阿难尊者。景点三亚南山寺大雄宝殿
- 不二法门：具有唐代风格的六层楼建筑，其广场内有建筑、群像雕塑、经幢、石刻、浮雕、园林等组成的景点，体现佛家“不二”理念。景点三亚南山寺不二法门
- 八宝莲池：面积为2200平方米，内有各种珊瑚石、海藻、水下灯具及琉璃制品。曲桥前方为“耳根圆通”石刻，旁边建有观音阁，阁上安放着造价约1.9亿元的金玉观音。景点三亚南山寺八宝莲池
- 吉祥如意园：有“吉祥如意”石刻、吉祥钟亭、仿古竹简巨幅石刻等，周围布满名家书法石刻，还有日本遣唐僧空海和尚铜像。
- 三十三观音堂：占地3300平方米，是展示观音文化、财神文化、民俗文化为一体的佛教文化场所，内有观音33种化身像。景点三亚南山寺三十三观音堂
重庆南山寺
- 天王殿：位于寺庙的第一进院落，殿中供奉弥勒佛、韦陀菩萨以及四大天王。景点重庆南山寺天王殿
- 大佛殿：殿内供奉着西南地区最大的室内大佛——八米高的释迦牟尼佛，此外还有三十二臂观音。
- 西方三圣殿：主要供奉西方三圣，同时还有文殊菩萨、普贤菩萨、南海观音、地藏王菩萨、燃灯佛等。
- 千手观音殿：殿内除了供奉千手观音外，还有药师佛、文武财神等。景点重庆南山寺千手观音殿
- 极乐殿：重庆唯一一家经民宗教部门批准的集佛教文化、墓园文化、人生文化、风水文化为一体的宗教设施。景点重庆南山寺极乐殿
五台山南山寺
- 佑国寺：南山寺最上面的一座寺院，有三进院落，三层佛殿，层层高起，浮雕多达1482幅。景点五台山南山寺佑国寺
- 善德堂：坐南朝北，呈长条形，纵向排列三处院落，前院内有钟、鼓二楼，有“南天门”之称。景点五台山南山寺善德堂
- 极乐寺：内有天王殿、大雄宝殿、观音殿、毗卢殿等建筑，大雄宝殿院内还有砖石舍利塔、西楼、南楼等。景点五台山南山寺极乐寺
- 大方光明砖雕影壁：由壁座、壁身和壁顶三部分组成，壁身中央镶嵌汉白玉雕刻的题字三方。
- 信天由命牌楼：建于民国26年（1937年），面宽13米，高8米，厚1.6米，三门三楼，中高侧低，主次分明，比例匀称。