崇明有许多好玩又舒适的住宿地点，以下是东、中、西部不同区域的推荐：
崇明岛东部
- 逅院：位于东滩湿地景区旁，环境安静，主理人是美食达人，能让游客品尝到特色美食。酒店上海崇明逅院
- 知谷1984：崇明最早一批的民宿，由老宅改造而成，有自家私房菜馆“知谷壹馆”，充满中式韵味。酒店上海崇明知谷1984
- 上海崇明如山酒店：毗邻东滩鸟类国家级自然保护区等景点，酒店设有户外儿童乐园、室内恒温泳池、棋牌室、健身中心等设施。
崇明岛中部
- 也山：日式装修风格，自带绿地、庭院，部分房间带独立泡池，还可预定餐饮，在房间内用餐，早餐丰盛。酒店上海崇明也山
- 东平草堂：仿北宋时期的建筑群，全榫卯木结构，古色古香，适合喜欢传统文化的游客。
- 松慢：店员热情，房间带泡池，民宿内有树林和挖沙池，还提供付费亲子活动和私房餐饮。
崇明岛西部
- 圭野藏红花民宿：带有一点日式庭院风格的小楼，距离花卷农场和明珠湖较近，带地暖，适合包栋。
- 香朵农场：由多栋乡村别墅改建而成，环境优美，分为一期和二期，游玩部分主要在一期。
- 西岸氧吧：有泳池，本身也是农家乐，游客可以在这里享受悠闲的乡村生活，体验农家乐趣。酒店上海崇明西岸氧吧