南华寺的景点众多，可分为建筑类、文物类及自然景观类，以下是一些主要的景点：
建筑类
- 曹溪门：南华禅寺的第一山门，始建于明嘉靖二十四年，经多次毁坏重建，现山门为1986年按原貌重建的钢筋混凝土结构仿古建筑，高12.5米，宽22.4米，上书“曹溪”及“南华禅寺”两块匾额。景点南华寺曹溪门
- 天王宝殿：原名“罗汉楼”，为单檐歇山顶，绿色琉璃瓦面，始建年代不详，现存为民国二十六年虚云法师移址重建。大殿内前后设有佛龛，前龛为弥勒佛，后龛为韦驮菩萨，两旁为四大天王塑像。
- 大雄宝殿：南华禅寺最大的主体建筑，始建于元成宗大德十年，现存为民国时期移址重建，2009年又进行了大规模重修。大殿正中供奉三尊高8.31米的三宝大佛，五百罗汉塑像分列大殿四壁及后屏墙。
- 藏经阁：一座两层的具有明代风格的楼阁式建筑，原名御经阁，始建于明英宗年间，用于贮藏明英宗御赐《大藏经》。楼下有观音菩萨圣像，珍藏有清朝钦颁龙藏佛典译经著作。
- 灵照塔：南华禅寺现存最古老且最高的建筑，为宋代风格的楼阁式八角形五层涩檐出平座砖塔，各层的转角和阑额均用红砂岩砌成，塔高29.6米，底径11米。
文物类
- 六祖真身：供奉在六祖殿内，是南华寺最为珍贵的文物，是以六祖惠能的肉身为基础，夹纻法塑造而成的坐像，高达80厘米。
- 唐代千佛袈裟：唐中宗赐给六祖惠能法师的罕见唐代传世刺绣，绢底呈杏黄色，上面绣有一千个佛像，佛像全部为结跏趺坐式。
- 五百罗汉群像：中国现存唯一的宋代木雕五百罗汉群像，雕于北宋仁宗庆历三年至八年，每尊像由底座和坐像两部分组成，木料主要是柏木。
自然景观类
- 卓锡泉：又名“九龙泉”，传说为六祖慧能浣洗袈裟之处，苏轼曾作《卓锡泉铭》记载。泉水清凉滑甘，赡足大众。
- 古水松：寺后有九株古老而稀有的水松，树围逾3米，高逾40米，树干挺拔，直耸云霄，树龄超过五百多年。景点南华寺古水松