南京有不少小众景点，自然景观类有宝卡湖、石臼湖等，历史文化类有达摩古洞、下关火车遗址公园等，休闲娱乐类有珍珠泉、桥北弘阳广场等，以下是具体介绍：
自然景观类
- 宝卡湖：藏身江宁青龙山脉中，是由废弃矿坑形成的湖，岸边岩石和湛蓝湖水相互映衬，风景绝美。目前未完全开发，需徒步前往。景点南京宝卡湖
- 石臼湖：位于南京溧水区、高淳区和安徽马鞍山市当涂县、博望区交界，湖面宽阔，湖水清澈，被誉为“天空之镜”，地铁S9号线横穿石臼湖，可体验“海上小火车”的感觉。
- 芝麻岭：又名止马岭，为苏皖两省界山，有千年黄栋树、百年板栗林，还有大泉水库，区内果林成片，鹅鸭成群，充满野趣。
历史文化类
- 达摩古洞：金陵四十八景之一，整座佛崖依山而建，有101尊神态各异的达摩雕像，沿着山路可爬上幕府山俯瞰南京城市全景。
- 下关火车遗址公园：这里有江风、夕阳、火车、站台以及废弃的轮渡旧址，充满复古氛围，是南京日落最美的地方之一。
- 毗卢寺：位于市中心新街口，是一处小众寺庙，整体为唐风建筑，寺中心的观自在菩萨较为出彩，据说求财很灵。
休闲娱乐类
- 珍珠泉：位于浦口区，有会冒泡的泉水，还有狮虎兽表演等游乐设施，也可以在此烧烤，适合亲子游玩。
- 桥北弘阳广场：是一个吃喝玩乐购的综合性场所，有大型游乐场，室内外都有游乐设施，适合年轻人和家庭游玩。
- 白鹭洲公园：是秦淮灯会的主会场，园内河道纵横，亭台楼阁，假山怪石点缀其中，在灯会期间更是热闹非凡，值得一逛。景点南京白鹭洲公园